ترون در بنونی، در استان ترانسفال (خائوتنگ از سال ۱۹۹۴) در آفریقای جنوبی، تنها فرزند راهسازان گِردا (با نام تولد ماریتز) و چارلز ترون (۲۷ نوامبر ۱۹۴۷–۲۱ ژوئن ۱۹۹۱) به دنیا آمد. دانیل ترون، رهبر نظامی جنگ بوئر دوم، عموی بزرگ او بود. او از یک خانواده آفریکانر است و اصل و نسب او شامل هلندی و همچنین فرانسوی و آلمانی است. اجداد فرانسوی او اوگنوهای اولیه در آفریقای جنوبی بودند. «ترون» (در اصل Théron) یک نام خانوادگی اکسیتانی است که در آفریکانس به صورت [trɔn] تلفظ میشود.
او در مزرعه والدینش در بنونی، نزدیک ژوهانسبورگ بزرگ شد. در ۲۱ ژوئن ۱۹۹۱ پدر الکلی ترون، هر دو چارلیز نوجوان و مادرش را در حال مستی تهدید کرده و بهطور فیزیکی به مادرش حمله کرد و با اسلحه به هر دوی آنها شلیک کرد. مادر ترون اسلحه دستی خود را گرفته و به او شلیک کرد و او را کشت. این تیراندازی از نظر قانونی دفاع شخصی شناخته شد و مادرش با هیچ اتهامی مواجه نشد.
ترون در مدرسه ابتدایی پوتفونتین (Laerskool Putfontein) شرکت کرد، دورهای که در طی آن او گفتهاست که خوب پیش نمیرفت. او در طول دوران کودکی اغلب با یرقان مریض میشد و آنتیبیوتیکهایی که به او داده شد باعث پوسیدگی دندانهای پیش بالای شیری او شد (که باید با جراحی برداشته میشد) و دندانها تا زمانی که او تقریباً ده سال داشت رشد نکردند. ترون در ۱۳ سالگی به مدرسه شبانهروزی فرستاده شد و تحصیلات خود را در مدرسه ملی هنر در ژوهانسبورگ آغاز کرد. اگرچه ترون به زبان انگلیسی مسلط است، زبان مادری او آفریکانس است.